Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01638 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01638 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01638 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01638 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01638 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01638 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01638 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01638 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01638 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01638 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01638 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01638 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01638 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01638 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01638 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01638 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01638 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01638 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01638 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01638 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01638 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01638 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01638 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01638 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01638 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
P01638 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01638 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01638 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01638 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01638 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01638 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01638 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01638 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01638 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01638 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01638 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
P01638 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01638 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01638 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01638 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01638 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01638 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01638 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01638 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01638 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01638 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01638 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01638 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01638 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01638 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01638 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01638 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01638 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01638 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01638 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01638 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01638 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01638 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01638 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01638 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01638 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01638 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01638 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01638 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01638 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01638 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01638 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01638 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01638 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P01638 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01638 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01638 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01638 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01638 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01638 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01638 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01638 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01638 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01638 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01638 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01638 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01638 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01638 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01638 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01638 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01638 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms