Protein–RNA interactions for Protein: P00405

Mtco2, Cytochrome c oxidase subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco2P00405 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtco2P00405 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtco2P00405 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms