Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap1O55125 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap1O55125 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms