Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf12O54907 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms