Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Per1O35973 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Per1O35973 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Per1O35973 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Per1O35973 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Per1O35973 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Per1O35973 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Per1O35973 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Per1O35973 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Per1O35973 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Per1O35973 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Per1O35973 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Per1O35973 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Per1O35973 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Per1O35973 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Per1O35973 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Per1O35973 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Per1O35973 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Per1O35973 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Per1O35973 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Per1O35973 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Per1O35973 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Per1O35973 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Per1O35973 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Per1O35973 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Per1O35973 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Per1O35973 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Per1O35973 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Per1O35973 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Per1O35973 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Per1O35973 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Per1O35973 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Per1O35973 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Per1O35973 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Per1O35973 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Per1O35973 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Per1O35973 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Per1O35973 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Per1O35973 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Per1O35973 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Per1O35973 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Per1O35973 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Per1O35973 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Per1O35973 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Per1O35973 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Per1O35973 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Per1O35973 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Per1O35973 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Per1O35973 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Per1O35973 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Per1O35973 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Per1O35973 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Per1O35973 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Per1O35973 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Per1O35973 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Per1O35973 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Per1O35973 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Per1O35973 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Per1O35973 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Per1O35973 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Per1O35973 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Per1O35973 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Per1O35973 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Per1O35973 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Per1O35973 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Per1O35973 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Per1O35973 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Per1O35973 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Per1O35973 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Per1O35973 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Per1O35973 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Per1O35973 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Per1O35973 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Per1O35973 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Per1O35973 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Per1O35973 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Per1O35973 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Per1O35973 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Per1O35973 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Per1O35973 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Per1O35973 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Per1O35973 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Per1O35973 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per1O35973 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per1O35973 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per1O35973 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per1O35973 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per1O35973 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per1O35973 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per1O35973 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per1O35973 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Per1O35973 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per1O35973 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per1O35973 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per1O35973 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Per1O35973 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per1O35973 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per1O35973 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per1O35973 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per1O35973 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms