Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3cdO35904 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pik3cdO35904 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pik3cdO35904 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms