Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NmiO35309 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NmiO35309 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NmiO35309 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NmiO35309 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NmiO35309 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NmiO35309 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NmiO35309 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NmiO35309 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NmiO35309 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NmiO35309 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NmiO35309 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NmiO35309 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NmiO35309 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NmiO35309 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NmiO35309 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NmiO35309 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NmiO35309 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NmiO35309 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NmiO35309 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NmiO35309 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NmiO35309 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NmiO35309 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NmiO35309 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NmiO35309 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NmiO35309 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NmiO35309 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NmiO35309 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NmiO35309 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NmiO35309 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NmiO35309 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NmiO35309 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NmiO35309 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NmiO35309 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NmiO35309 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms