Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pkd2O35245 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkd2O35245 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms