Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dctn1O08788 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dctn1O08788 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms