Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX0

5730507C01Rik, RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730507C01RikJ3QPX0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
5730507C01RikJ3QPX0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5730507C01RikJ3QPX0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms