Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM7

Gm5426, MCG51915, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5426J3QNM7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5426J3QNM7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5426J3QNM7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5426J3QNM7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5426J3QNM7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5426J3QNM7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm5426J3QNM7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm5426J3QNM7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm5426J3QNM7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm5426J3QNM7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm5426J3QNM7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm5426J3QNM7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5426J3QNM7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms