Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17ldG5E8G2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp17ldG5E8G2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17ldG5E8G2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms