Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20517G3UVU6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20517G3UVU6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20517G3UVU6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20517G3UVU6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20517G3UVU6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20517G3UVU6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20517G3UVU6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms