Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
D430041D05RikF6ZGR6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
D430041D05RikF6ZGR6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms