Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syngap1F6SEU4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Syngap1F6SEU4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms