Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss56F2YMG0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms