Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3hdm1E9Q9Q2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms