Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
8030474K03RikE9Q4Y8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
8030474K03RikE9Q4Y8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms