Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms