Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcc4E9Q236 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcc4E9Q236 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc4E9Q236 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms