Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd1E9PZ26 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd1E9PZ26 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd1E9PZ26 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd1E9PZ26 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd1E9PZ26 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd1E9PZ26 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd1E9PZ26 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd1E9PZ26 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd1E9PZ26 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Brd1E9PZ26 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 312.3 ms