Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc62E9PVD1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc62E9PVD1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms