Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc6D3YZP9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc6D3YZP9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc6D3YZP9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms