Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Polr3aB2RXC6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Polr3aB2RXC6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr3aB2RXC6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms