Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1B2KF50 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1B2KF50 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uhrf1bp1B2KF50 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms