Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT1A5YKK6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT1A5YKK6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms