Protein–RNA interactions for Protein: A2CG71

Btbd35f19, BTB domain-containing 35, family member 19, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f19A2CG71 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f19A2CG71 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Btbd35f19A2CG71 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Btbd35f19A2CG71 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Btbd35f19A2CG71 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Btbd35f19A2CG71 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Btbd35f19A2CG71 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Btbd35f19A2CG71 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Btbd35f19A2CG71 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms