Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef25A2ASI9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef25A2ASI9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms