Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhbdl2A2AGA4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms