Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms