Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm10874-201ENSMUST00000100526 2355 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Sfmbt1-202ENSMUST00000112184 2936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms