Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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