Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm28274-202ENSMUST00000187775 1157 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm28202-203ENSMUST00000189780 1157 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms