Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Riok3Q9DBU3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Riok3Q9DBU3 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Riok3Q9DBU3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Riok3Q9DBU3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Riok3Q9DBU3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Riok3Q9DBU3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Riok3Q9DBU3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Riok3Q9DBU3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps113-201ENSMUST00000121318 1106 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm18339-201ENSMUST00000218074 888 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 1700015F17Rik-201ENSMUST00000115447 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm3235-201ENSMUST00000168442 695 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms