Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Platr22-201ENSMUST00000181274 1617 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms