Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms