Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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