Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PclafQ9CQX4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms