Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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