Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atg3Q9CPX6 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms