Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm18492-201ENSMUST00000198141 1018 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ms4a4dQ99N05 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms