Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms