Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PtprtQ99M80 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PtprtQ99M80 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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