Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rab28Q99KL7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rab28Q99KL7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rab28Q99KL7 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rab28Q99KL7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rab28Q99KL7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rab28Q99KL7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rab28Q99KL7 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rab28Q99KL7 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rab28Q99KL7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab28Q99KL7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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