Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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