Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.7 ms