Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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