Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Csnka2ipQ8CH19 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Csnka2ipQ8CH19 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Csnka2ipQ8CH19 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Csnka2ipQ8CH19 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Csnka2ipQ8CH19 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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