Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms