Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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